儘管水觸媒的應用範疇廣泛而且效能優越,但需要注意的是全世界任何的觸媒也有其限制,畢竟觸媒並非「神仙水」,以下是所有觸媒均不能做到的三項限制:
現實中並沒有任何觸媒能對於高濃度的VOCs作出無限量分解並於數十小時內把化學品味道完全消除。這跟「核子彈」不能無限量爆發的原理同出一轍。
水觸媒基本上能分解所有含C(碳)、H(氫)、O(氧)元素的化學結構,藉此消除如甲醛、阿摩尼亞及香煙等臭味,而其長效抗菌功效亦能讓細菌無法繼續繁殖,既然無菌,又何來細菌所產生的味道?但假若所產生氣味的物質結構不含C、H及O此三種元素,像物料本身的味道等,那觸媒便無法分解消除。
所有的觸媒及臭氧均無穿透或滲透能力,因此觸媒只能於物件表面分解VOCs、甲醛並產生抗菌效果而不能穿透牆身或傢具深層進行分解。切記,世上便只有「輻射」才具穿透能力。